L'église Saint-Pierre de Tonnerre a commencé sa vie au IXe siècle, mais elle a failli ne pas la finir. En 1556, un incendie dévasta la ville entière et détruisit presque tout ce qui était bâti. L'église, elle aussi, a brûlé. Ce qu'on voit aujourd'hui, c'est une reconstruction, patiente et progressive, qui a continué bien au-delà du sinistre.
À l'intérieur, il reste des traces de cette longue histoire. Des vitraux du XVIe siècle ont survécu au feu, puis ont attendu jusqu'en 2003 pour être restaurés. Un orgue dont le buffet remonte à 1616 occupe sa place depuis des siècles. Une chaire à prêcher, sculptée dans les années 1712-1713, se dresse encore pour les sermons.
La façade elle-même raconte cette reconstruction: elle arbore le style baroque, celui des édifices relevés après les catastrophes, quand on voulait montrer une certaine autorité retrouvée. Depuis sa position dominant la ville, elle offre un panorama sur Tonnerre.
Il ne subsiste rien de l'ancienne chapelle du XIe siècle qui se trouvait là avant. Tout a cédé à l'incendie ou aux modifications successives. C'est l'édifice qui s'est reconstruit après 1556, enrichi des apports de trois siècles. L'église a été classée au titre des monuments historiques en 1920.